場地

1. 耗資近四億元興建、年底東亞運動會將產生四十六面田徑金牌的將軍澳運動場，國際賽場上罕見的綠色跑道本為場館其中一大特色，但場館啟用後僅三個月跑道便出現拱起現象，成了絆倒選手陷阱。將軍澳運動場2009年5月啟用時，已被揭發積水處處。學者認為情況不尋常，促康文署加緊檢查，免香港淪為國際笑柄，更有人狠批康文署驗收馬虎。
2. 東亞運不少項目於社區體育場館進行，部分場地被批評地點隔涉交通不便、缺乏配套設施，例如西區公園體育館地點隔涉；石硤尾公園體育館交通不便而且缺乏指示；BMX（小輪車）比賽的地點，位於荃灣華人永遠墳場附近的醉酒灣垃圾堆填區上，連很多港人也未必知道如何前往。政府表示賽事與行期間將設有免費穿梭巴士來往葵芳港鐵站和小輪車比賽場地。
3. 射擊賽事原本在新建的屯門望后石谷戶外場地進行，不過由於涉及繁雜的工程程序，政府太遲批出土地牌照，導致香港射擊總會未能籌得足夠建造經費，無法如期在東亞運前建成場地，賽事需改在南華體育會室內較細小場地舉行，賽事規模因而大幅縮減，由於南華會只有一個10米場，所以原定的9個25米及50米射擊項目被迫取消，由13個金牌項目減至4個，只剩男、女子10米氣手槍及氣步槍四個項目。香港政府被批評過份官僚，而且沒有大力支持東亞運動會的籌備工作。