政治事件

本篤十六世一直強調宗教對於世界和平的影響，並且身體力行積極關注並參與國際事務，特別是有關中東問題。

早在就任教宗之前他就曾公開批評美國總統布殊和伊拉克戰爭，認為這是一場非正義的戰爭，它所造成的破壞將遠遠大於想要拯救的價值觀念。他也稱讚伊斯蘭教的教義，並對穆斯林虔誠的信仰和高尚的道德表示讚揚。儘管他強調，伊斯蘭教是多樣化的宗教，但他同時認為，將穆斯林指責為恐怖分子是錯誤的。而且他也不同意9·11之後布殊的「反恐戰爭是一場十字軍東徵」的說法。本篤十六世主張各方和平解決伊朗核危機。

2005年諷刺穆斯林先知穆罕默德的漫畫風波發生後，本篤十六世表示了譴責的立場。他要求本著相互尊重的原則在世界各地實現宗教自由。

2006年黎以衝突發生後，本篤十六世通過梵蒂岡電台譴責以色列進攻黎巴嫩，指出這是對一個主權國家的侵犯，教宗將與那些受苦受難並保衛國家獨立的人們同在。他還號召世界人民共同為其早日停火祈禱。他說：「對所有人來說，戰爭都是最壞的解決辦法，它帶給人們的只有壞處，對勝利者也是如此。人們需要的是和平。我們將運用各種道德力量幫助人們瞭解人類共存是惟一的出路。」

2012年本篤十六世訪問黎巴嫩

2006年9月12日，教宗發表演講時指，伊斯蘭教先知穆罕默德的部份教導是「邪惡與不人道」，他下令以利劍傳播教義，帶來邪惡。教宗的講話被普遍的穆斯林指為對伊斯蘭教的抵毀和冒犯「伊斯蘭教以暴力傳道」的論調引起全球穆斯林強烈反響，多處地方有示威抗議，其中加沙有五千人示威；哈馬斯高層強烈不滿，認為是另一次十字軍戰爭；巴基斯坦就通過決議，譴責教宗；伊斯坦堡有示威抗議，土耳其表示將取消教宗的訪問；摩洛哥宣佈，召回駐梵蒂岡的大使，以瞭解教宗本篤十六世對伊斯蘭教的言論。

2006年1月20日本篤十六世在一私人聽證會上

教宗這番話是來自15世紀拜佔庭帝國皇帝曼努埃爾二世（1350－1425年）曾說過的話。曼努埃爾二世曾在1373年被送往鄂圖曼帝國當人質，直到他的父親過世，他才逃回國內繼位，最後還是不敵鄂圖曼的侵吞野心，在他去世的前一年，與鄂圖曼帝國簽下合約並賠款。也因如此，使得曼努埃爾二世特別憎恨穆斯林。這個讓曼努埃爾憎恨的鄂圖曼帝國，為了擴張領域，經常攻打東羅馬帝國。自從十五世紀君士坦丁堡被奧托曼土耳其人攻陷，信仰基督的拜佔庭帝國滅亡後，伊斯坦布爾的基督信徒便日漸減少。二十世紀七十年代的伊斯坦布爾和土耳其全國還有叄十萬東正教徒，但在缺乏宗教自由保障的局勢下，今天只剩下叄千人，大部分信徒都前往歐美各地。

2006年9月16日，本篤十六世發表聲明，對他較早時的言論令伊斯蘭教徒感到受傷害，表達抱歉。教宗表示，他尊重伊斯蘭教的信仰，並希望大家能明白他發言的真意。教廷解釋說，教宗無意冒犯伊斯蘭教，德國總理默克爾表示，教宗的言論被人誤解，他只是譴責以宗教名義發動暴力活動。聖座國務卿達濟斯·貝爾托內樞機在一份聲明中表示：「教宗對其言論之部份內容令伊斯蘭教徒覺得被冒犯感到非常遺憾」。CNN認為聖座這份聲明不屬於正式道歉，但隨後三十八位伊斯蘭宗教領袖聯名表示願意接受教宗致歉。

為修補裂痕及改善天主教與東正教和穆斯林的關係，本篤十六世在同年11月28日展開一連四日的土耳其訪問行程。這是教宗本篤十六世對這個穆斯林佔多數的國家進行的首次訪問，他在位於伊茲密爾的以弗所（Efeso）舉行了彌撒祭，並與東正教宗主教巴爾多祿茂一世舉行了會談。對於這次的訪問，許多宗教人士認為是十分成功的，緩解了基督宗教世界與伊斯蘭教世界的衝突，同時表現出了西方世界願意與伊斯蘭世界和平共存的願望。同時土耳其當地的報紙也紛紛發表評論，積極的肯定了教宗的這次訪問，架起了穆斯林世界和西方基督宗教世界的橋樑，使雙方都能進一步的進行對話，消除分歧。據悉在教宗離開土耳其之前的講話中，他表示這次的訪問打開了對話，但他本人更希望「這樣的對話能繼續下去」。

避孕套

2009年3月17日，本篤十六世在一次公開演講時說，避孕套不能解決非洲的愛滋病問題，事實上，它反而會加劇愛滋病問題；因為真正解決辦法是避免婚前性行為，而非消極發放保險套，該言論引發爭議，聖座表示教宗的講話和羅馬天主教會反對使用避孕用具的教條一致。但許多衛生官員都仍建議使用避孕套來預防愛滋病毒的擴散。法國和德國官員以及愛滋病活動人士批評教宗的說法。西班牙衛生部表示將向非洲運送100萬個避孕套對抗愛滋病的擴散。一名法國外交部發言人說儘管法國無權對天主教教條作價值判斷，但是法國認為教宗的言論對於公共衛生政策和保護生命的責任是一種威脅。事實上，有關避孕套的言論並不能視作教宗的私人言論，而是天主教的教義之一：依據《天主教教理》第三卷第二部分第二章第五條，天主教會確信，生育是一個恩賜、是婚姻的一個目的，夫妻奉召傳衍生命以分享天主的創造能力及父性，而包括使用避孕套在內的任何阻止生育的行為都是錯誤的。